Wśród jednostek pozawydziałowych Uniwersytetu Ekonomicznego w Krakowie szczególne miejsce zajmuje Krakowska Szkoła Biznesu. Jest to prestiżowa jednostka, która przygotowuje studentów do odpowiedzialnego i profesjonalnego funkcjonowania w przestrzeni gospodarczej. Studia menedżerskie dla kadry kierowniczej - Master of Business Administration są jednymi z najlepszych w regionie. Zdobyta podczas nich wiedza i zawarte kontakty dają przewagę konkurencyjną na rynku pracy oraz stanowią duży krok w rozwoju kariery zawodowej.

Małopolska Szkoła Administracji Publicznej jako jednostka pozawydziałowa Uniwersytetu Ekonomicznego w Krakowie oferuje studia podyplomowe, których celem jest wspieranie Państwa w dążeniach do spełniania ambitnych celów zawodowych. Studia te kierowane są do grona osób zatrudnionych w instytucjach publicznych, organizacjach społecznych i podmiotach gospodarczych, pragnących zdobyć dodatkowe kwalifikacje w obszarze własnej specjalizacji lub zainteresowanych uzyskaniem wiedzy w nowych dziedzinach.

Szkoła Giełdowa w Krakowie funkcjonuje na zasadzie partnerskiej współpracy Giełdy Papierów Wartościowych w Warszawie oraz Uniwersytetu Ekonomicznego w Krakowie. Działalność Szkoły Giełdowej polega na organizowaniu kursów dotyczących problematyki inwestowania w papiery wartościowe. Z ramienia Uniwersytetu Ekonomicznego organizacją kursów zajmuje się Katedra Rynków Finansowych. Uczestnikiem kursu Szkoły Giełdowej może być każdy zainteresowany poszerzeniem swojej wiedzy na temat inwestycji na rynku kapitałowym.